Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp9cQ66X01 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp9cQ66X01 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp9cQ66X01 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp9cQ66X01 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp9cQ66X01 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrp9cQ66X01 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp9cQ66X01 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrp9cQ66X01 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.9 ms