Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pou4f3Q63955 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pou4f3Q63955 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.2 ms