Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd180Q62192 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd180Q62192 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd180Q62192 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd180Q62192 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd180Q62192 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd180Q62192 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd180Q62192 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd180Q62192 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd180Q62192 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd180Q62192 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd180Q62192 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd180Q62192 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd180Q62192 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd180Q62192 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd180Q62192 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd180Q62192 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd180Q62192 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd180Q62192 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd180Q62192 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd180Q62192 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd180Q62192 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms