Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PtafrQ62035 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtafrQ62035 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtafrQ62035 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.1 ms