Protein–RNA interactions for Protein: Q61553

Fscn1, Fascin, mousemouse

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn1Q61553 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fscn1Q61553 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fscn1Q61553 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fscn1Q61553 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fscn1Q61553 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fscn1Q61553 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fscn1Q61553 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fscn1Q61553 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fscn1Q61553 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fscn1Q61553 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fscn1Q61553 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fscn1Q61553 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fscn1Q61553 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fscn1Q61553 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fscn1Q61553 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fscn1Q61553 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fscn1Q61553 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fscn1Q61553 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fscn1Q61553 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fscn1Q61553 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms