Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gbp4Q61107 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp4Q61107 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp4Q61107 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp4Q61107 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms