Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc88aQ5SNZ0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.4 ms