Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm27Q5SFM8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rbm27Q5SFM8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
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