Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rapgef6Q5NCJ1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rapgef6Q5NCJ1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rapgef6Q5NCJ1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Rapgef6Q5NCJ1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rapgef6Q5NCJ1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rapgef6Q5NCJ1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Rapgef6Q5NCJ1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Rapgef6Q5NCJ1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Rapgef6Q5NCJ1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rapgef6Q5NCJ1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rapgef6Q5NCJ1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rapgef6Q5NCJ1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rapgef6Q5NCJ1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rapgef6Q5NCJ1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rapgef6Q5NCJ1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Rapgef6Q5NCJ1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rapgef6Q5NCJ1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Rapgef6Q5NCJ1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Rapgef6Q5NCJ1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Rapgef6Q5NCJ1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Rapgef6Q5NCJ1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rapgef6Q5NCJ1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rapgef6Q5NCJ1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rapgef6Q5NCJ1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rapgef6Q5NCJ1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rapgef6Q5NCJ1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Rapgef6Q5NCJ1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rapgef6Q5NCJ1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rapgef6Q5NCJ1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rapgef6Q5NCJ1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rapgef6Q5NCJ1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rapgef6Q5NCJ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rapgef6Q5NCJ1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rapgef6Q5NCJ1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rapgef6Q5NCJ1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rapgef6Q5NCJ1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rapgef6Q5NCJ1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rapgef6Q5NCJ1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rapgef6Q5NCJ1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms