Protein–RNA interactions for Protein: Q497M0

Samt2, Predicted gene, EG434881, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt2Q497M0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Samt2Q497M0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samt2Q497M0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samt2Q497M0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Samt2Q497M0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samt2Q497M0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms