Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Carmil2Q3V3V9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Carmil2Q3V3V9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.5 ms