Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnpc3Q3UZ01 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnpc3Q3UZ01 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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