Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SfswapQ3USH5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SfswapQ3USH5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SfswapQ3USH5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms