Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec31aQ3UPL0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sec31aQ3UPL0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms