Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc33Q3ULW6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc33Q3ULW6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc33Q3ULW6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.1 ms