Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Lmod2Q3UHZ5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Lmod2Q3UHZ5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Lmod2Q3UHZ5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Lmod2Q3UHZ5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Lmod2Q3UHZ5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Lmod2Q3UHZ5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Lmod2Q3UHZ5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Lmod2Q3UHZ5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Lmod2Q3UHZ5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Lmod2Q3UHZ5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Lmod2Q3UHZ5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Lmod2Q3UHZ5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Lmod2Q3UHZ5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Lmod2Q3UHZ5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Lmod2Q3UHZ5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Lmod2Q3UHZ5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Lmod2Q3UHZ5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Lmod2Q3UHZ5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Lmod2Q3UHZ5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Lmod2Q3UHZ5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Lmod2Q3UHZ5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Lmod2Q3UHZ5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Lmod2Q3UHZ5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Lmod2Q3UHZ5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Lmod2Q3UHZ5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Lmod2Q3UHZ5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 316.3 ms