Protein–RNA interactions for Protein: Q3U552

A930003A15Rik, RIKEN cDNA A930003A15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930003A15RikQ3U552 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A930003A15RikQ3U552 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A930003A15RikQ3U552 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A930003A15RikQ3U552 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.6 ms