Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ulk3Q3U3Q1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ulk3Q3U3Q1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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