Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc4Q3TR08 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fndc4Q3TR08 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms