Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU8

Bpifa6, BPI fold-containing family A, member 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa6Q0VGU8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bpifa6Q0VGU8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bpifa6Q0VGU8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bpifa6Q0VGU8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms