Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rundc1Q0VDN7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rundc1Q0VDN7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rundc1Q0VDN7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms