Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms