Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CbfbQ08024 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CbfbQ08024 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms