Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prrx2Q06348 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrx2Q06348 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms