Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPINDOCQ05AH6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPINDOCQ05AH6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPINDOCQ05AH6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms