Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r236Q05A06 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r236Q05A06 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms