Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top1Q04750 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top1Q04750 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top1Q04750 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1Q04750 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top1Q04750 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top1Q04750 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top1Q04750 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top1Q04750 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top1Q04750 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top1Q04750 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top1Q04750 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms