Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apoa1Q00623 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms