Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfra1P97785 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfra1P97785 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms