Protein–RNA interactions for Protein: P70323

Tbx1, T-box transcription factor TBX1, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx1P70323 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbx1P70323 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tbx1P70323 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tbx1P70323 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Tbx1P70323 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tbx1P70323 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms