Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CgnP59242 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CgnP59242 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CgnP59242 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CgnP59242 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CgnP59242 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CgnP59242 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CgnP59242 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CgnP59242 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CgnP59242 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CgnP59242 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CgnP59242 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CgnP59242 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CgnP59242 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CgnP59242 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CgnP59242 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CgnP59242 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CgnP59242 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CgnP59242 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CgnP59242 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CgnP59242 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CgnP59242 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CgnP59242 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CgnP59242 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CgnP59242 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CgnP59242 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CgnP59242 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CgnP59242 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CgnP59242 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CgnP59242 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CgnP59242 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CgnP59242 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CgnP59242 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CgnP59242 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CgnP59242 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CgnP59242 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CgnP59242 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CgnP59242 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CgnP59242 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CgnP59242 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CgnP59242 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CgnP59242 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CgnP59242 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CgnP59242 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CgnP59242 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CgnP59242 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CgnP59242 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CgnP59242 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CgnP59242 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CgnP59242 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CgnP59242 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CgnP59242 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CgnP59242 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CgnP59242 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CgnP59242 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CgnP59242 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CgnP59242 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CgnP59242 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CgnP59242 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CgnP59242 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CgnP59242 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CgnP59242 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CgnP59242 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CgnP59242 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CgnP59242 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CgnP59242 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CgnP59242 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CgnP59242 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CgnP59242 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CgnP59242 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CgnP59242 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CgnP59242 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CgnP59242 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CgnP59242 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CgnP59242 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CgnP59242 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CgnP59242 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CgnP59242 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CgnP59242 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CgnP59242 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CgnP59242 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CgnP59242 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CgnP59242 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CgnP59242 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CgnP59242 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CgnP59242 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CgnP59242 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CgnP59242 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CgnP59242 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CgnP59242 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CgnP59242 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CgnP59242 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CgnP59242 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CgnP59242 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CgnP59242 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CgnP59242 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CgnP59242 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CgnP59242 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CgnP59242 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CgnP59242 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms