Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bace1P56818 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bace1P56818 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bace1P56818 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bace1P56818 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bace1P56818 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bace1P56818 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bace1P56818 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Bace1P56818 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bace1P56818 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bace1P56818 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Bace1P56818 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bace1P56818 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms