Protein–RNA interactions for Protein: P56564

Slc1a3, Excitatory amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a3P56564 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc1a3P56564 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slc1a3P56564 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms