Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CnbpP53996 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CnbpP53996 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CnbpP53996 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CnbpP53996 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CnbpP53996 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CnbpP53996 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CnbpP53996 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CnbpP53996 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CnbpP53996 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CnbpP53996 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CnbpP53996 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CnbpP53996 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CnbpP53996 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CnbpP53996 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CnbpP53996 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CnbpP53996 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CnbpP53996 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CnbpP53996 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CnbpP53996 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CnbpP53996 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CnbpP53996 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CnbpP53996 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnbpP53996 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnbpP53996 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnbpP53996 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CnbpP53996 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms