Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Map3k1P53349 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Map3k1P53349 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Map3k1P53349 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Map3k1P53349 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Map3k1P53349 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Map3k1P53349 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Map3k1P53349 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Map3k1P53349 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Map3k1P53349 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Map3k1P53349 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Map3k1P53349 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Map3k1P53349 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Map3k1P53349 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Map3k1P53349 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Map3k1P53349 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Map3k1P53349 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Map3k1P53349 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Map3k1P53349 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Map3k1P53349 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
Map3k1P53349 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Map3k1P53349 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Map3k1P53349 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Map3k1P53349 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Map3k1P53349 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Map3k1P53349 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Map3k1P53349 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Map3k1P53349 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Map3k1P53349 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Map3k1P53349 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Map3k1P53349 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Map3k1P53349 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Map3k1P53349 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Map3k1P53349 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Map3k1P53349 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Map3k1P53349 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Map3k1P53349 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Map3k1P53349 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Map3k1P53349 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Map3k1P53349 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Map3k1P53349 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Map3k1P53349 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Map3k1P53349 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Map3k1P53349 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Map3k1P53349 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Map3k1P53349 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Map3k1P53349 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Map3k1P53349 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Map3k1P53349 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Map3k1P53349 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC32.64■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms