Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csrp3P50462 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Csrp3P50462 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csrp3P50462 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms