Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tmod1P49813 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmod1P49813 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms