Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psen1P49769 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psen1P49769 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psen1P49769 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Psen1P49769 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Psen1P49769 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Psen1P49769 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psen1P49769 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psen1P49769 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psen1P49769 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Psen1P49769 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms