Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox2P48432 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox2P48432 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox2P48432 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox2P48432 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox2P48432 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox2P48432 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox2P48432 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox2P48432 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox2P48432 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox2P48432 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 443.7 ms