Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Epb41P48193 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Epb41P48193 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Epb41P48193 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Epb41P48193 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Epb41P48193 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Epb41P48193 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Epb41P48193 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Epb41P48193 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Epb41P48193 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Epb41P48193 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Epb41P48193 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epb41P48193 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epb41P48193 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epb41P48193 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms