Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx2-5P42582 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx2-5P42582 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms