Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ly6dP35459 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ly6dP35459 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly6dP35459 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms