Protein–RNA interactions for Protein: P31361

Pou3f3, POU domain, class 3, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f3P31361 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pou3f3P31361 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pou3f3P31361 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pou3f3P31361 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pou3f3P31361 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pou3f3P31361 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pou3f3P31361 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pou3f3P31361 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pou3f3P31361 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pou3f3P31361 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pou3f3P31361 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pou3f3P31361 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pou3f3P31361 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pou3f3P31361 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pou3f3P31361 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pou3f3P31361 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pou3f3P31361 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pou3f3P31361 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pou3f3P31361 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pou3f3P31361 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pou3f3P31361 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pou3f3P31361 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pou3f3P31361 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms