Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Cnga1P29974 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cnga1P29974 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cnga1P29974 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cnga1P29974 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cnga1P29974 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cnga1P29974 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Cnga1P29974 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cnga1P29974 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cnga1P29974 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cnga1P29974 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cnga1P29974 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Cnga1P29974 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cnga1P29974 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cnga1P29974 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cnga1P29974 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cnga1P29974 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Cnga1P29974 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cnga1P29974 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cnga1P29974 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cnga1P29974 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cnga1P29974 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cnga1P29974 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cnga1P29974 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cnga1P29974 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms