Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Casp1P29452 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Casp1P29452 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Casp1P29452 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casp1P29452 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casp1P29452 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casp1P29452 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Casp1P29452 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casp1P29452 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casp1P29452 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casp1P29452 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casp1P29452 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casp1P29452 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms