Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmb9P28076 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Psmb9P28076 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb9P28076 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms