Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tpm3P21107 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tpm3P21107 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms