Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NelfeP19426 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NelfeP19426 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NelfeP19426 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NelfeP19426 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NelfeP19426 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NelfeP19426 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NelfeP19426 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NelfeP19426 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NelfeP19426 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NelfeP19426 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NelfeP19426 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NelfeP19426 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NelfeP19426 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NelfeP19426 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NelfeP19426 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NelfeP19426 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NelfeP19426 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NelfeP19426 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NelfeP19426 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NelfeP19426 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NelfeP19426 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NelfeP19426 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NelfeP19426 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NelfeP19426 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NelfeP19426 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NelfeP19426 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NelfeP19426 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NelfeP19426 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NelfeP19426 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NelfeP19426 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NelfeP19426 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NelfeP19426 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NelfeP19426 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NelfeP19426 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NelfeP19426 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NelfeP19426 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NelfeP19426 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NelfeP19426 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NelfeP19426 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NelfeP19426 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NelfeP19426 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NelfeP19426 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NelfeP19426 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NelfeP19426 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NelfeP19426 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NelfeP19426 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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