Protein–RNA interactions for Protein: P18826

Phka1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phka1P18826 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phka1P18826 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phka1P18826 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phka1P18826 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phka1P18826 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phka1P18826 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Phka1P18826 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phka1P18826 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phka1P18826 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phka1P18826 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phka1P18826 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phka1P18826 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phka1P18826 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.8 ms