Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18528 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18528 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18528 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18528 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18528 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18528 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18528 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18528 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18528 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18528 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18528 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18528 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18528 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18528 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18528 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18528 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18528 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18528 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18528 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18528 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18528 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18528 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18528 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18528 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18528 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18528 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18528 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18528 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18528 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18528 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18528 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18528 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P18528 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18528 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18528 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18528 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18528 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18528 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P18528 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P18528 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18528 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18528 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18528 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18528 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18528 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18528 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18528 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18528 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18528 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P18528 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18528 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P18528 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
P18528 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P18528 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P18528 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P18528 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P18528 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P18528 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P18528 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P18528 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P18528 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P18528 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P18528 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P18528 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P18528 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P18528 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P18528 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P18528 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P18528 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P18528 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P18528 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P18528 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P18528 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P18528 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P18528 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P18528 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P18528 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P18528 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P18528 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P18528 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P18528 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P18528 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P18528 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P18528 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P18528 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P18528 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P18528 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P18528 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P18528 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P18528 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P18528 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P18528 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P18528 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P18528 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P18528 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P18528 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P18528 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P18528 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P18528 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms